A Mata de Santa Genebra sofre vários tipos de ameaças diariamente. Dentre elas podemos citar os riscos de incêndio, a especulação imobiliária, invasões, a deposição de entulho, a erosão do solo e o assoreamento dos brejos, a contaminação da água por esgoto doméstico, o uso de agrotóxicos, a caça, a presença de animais domésticos e de criminosos, e os efeitos de borda.

1. Risco de Incêndio

Os incêndios geralmente ocorrem durante a época de estiagem, quando o tempo costuma ficar frio e com baixa umidade relativa do ar. Nesta época, a mata perde parte de suas folhas, gerando uma cobertura de folhas secas no solo, também chamada de serrapilheira, um material altamente combustível, tornando a mata ainda mais vulnerável durante o inverno.Este material é um dos pilares mais importantes para manter a ocorrência de incêndios, e torna o seu combate ainda mais difícil quando este ocorre na mata.

A ocorrência de incêndios é constante no entorno da mata, áreas geralmente cobertas de capim, um material que se incinera com grande facilidade, especialmente em dias quentes e secos. As chamas, se não controladas, adentram a mata e iniciam um incêndio de grandes proporções e de difícil combate.  As causas de incêndio são diversas, e podemos citar as mais importantes:

- Incendiários: pessoas que simplesmente ateiam fogo quando localizam áreas passíveis a sofrerem incêndio,

- Queima para limpeza: áreas queimadas para fins agrícolas ou pecuários,

- Fumantes: transeuntes que descartam seus cigarros acesos em áreas passíveis de sofrerem incêndio,

- Recreação: fogos causados por pessoas que acendem fogueiras em áreas próximas à mata,

- Ritos religiosos: quando velas acesas são deixadas em áreas próximas às matas,

- Balões: a queda de balões inicia incêndios em qualquer área, de grandes proporções e de difícil controle. Incêndios que se iniciam no interior da mata, geralmente são causados devido à queda de balões. Os principais incêndios que ocorreram na Mata, em 1981, quando 10 hectares da mata se incendiaram, e em 2003, quando 20 hectares se incendiaram, foram causados pela queda de balões.

Os métodos utilizados para combater os incêndios são:

- Manutenção do aceiro: os aceiros tanto da Fundação, quanto da propriedade anexa, devem ser mantidos limpos e livres de capim, para que não propaguem incêndios. Os aceiros podem ser estradas de passagem ou faixas livres de vegetação onde o solo se apresenta exposto.

- Corte periódico do capim: para eliminar a possibilidade de incêndios nas áreas infestadas.

- Vigilância constante: guardas motorizados vistoriam o entorno da mata, para verificar a ocorrência de incêndios,

- Auxílio da população: Quando da ocorrência de incêndio, a Fundação é contatada pelos moradores para relatar o ocorrido,

- Combate: a Fundação possui dois caminhões de combate a incêndio, e o auxílio de todos seus funcionários treinados utilizando-se de abafadores.

Deve-se ressaltar que os riscos de incêndio são maiores nas áreas de floresta, pois as chamas são muito altas quando as copas se incendeiam. Vários fatores inibem o combate, como os buracos, troncos, emaranhados de cipó, charcos, e o perigo de queda de árvores.

A ocorrência de ventos durante os incêndios colabora para o aumento das proporções do mesmo, tornando o combate ainda mais difícil, pois ele seca o material combustível. Além disso, por carrear fagulhas, o vento cria novos focos de incêndio, além de causar fogo nas copas das árvores (forma de incêndio florestal mais difícil de ser combatido).

Logo, quanto mais rápida for a detecção do foco de incêndio, mais fácil será seu combate, pois sua propagação é muito rápida.

Os incêndios florestais causam diversos danos à floresta, dentre eles: A morte das árvores ou sua debilitação, tornando-as susceptíveis ao ataque de doenças; morte de animais e perda de seus abrigos, filhotes e fontes de alimento e a morte de todos os microorganismos presentes na camada superficial do solo.

2. Especulação Imobiliária

A Mata de Santa Genebra se encontra em Barão Geraldo, um distrito da cidade de Campinas que possui uma das maiores universidades do Brasil, a Unicamp. Devido a isso, possui uma grande quantidade de residências, para acomodar seus alunos e professores, além de várias famílias que buscam conforto e tranqüilidade. Com isso, o distrito vem crescendo cada vez mais, para acomodar as novas moradias e toda a infra-estrutura necessária.

A Mata de Santa Genebra sofre com este crescimento urbano, pois áreas anteriormente utilizadas para agricultura, se tornaram bairros e condomínios, gerando vários tipos de problemas, como a entrada de animais na residência das pessoas, impermeabilização do solo, entrada de animais domésticos na mata, poluição sonora, poluição do ar, e entrada de pessoas estranhas na reserva.

3. Invasões

A iminência de invasões não é incomum nas novas áreas tombadas da reserva, sendo uma ameaça constante. Estas áreas serão recuperadas no futuro, com o plantio de árvores nativas.

No momento estão ociosas, e próximas das áreas urbanizadas, que possuem infra-estrutura, como água encanada, encanamento de esgoto, luz, telefone e linhas de ônibus, fatores que favorecem a ocorrência de invasões.

Logo, a Fundação José Pedro de Oliveira, em conjunto com a Prefeitura Municipal, deve zelar pela conservação das áreas tombadas, para que as mesmas sejam recuperadas.

4. Deposição de entulho

A Mata de Santa Genebra também recebe deposição de entulho, especialmente na área recentemente tombada. Por ser uma área erma e de passagem, muitas pessoas descartam entulho e restos de jardinagem na borda da mata, causando degradação e riscos de incêndios.

5. Erosão do solo

Por receber uma grande descarga de água pluvial, o aceiro da Mata de Santa Genebra é vítima constante de erosão e de conseqüente assoreamento de suas nascentes e de seus ribeirões. A manutenção da borda, buscando reduzir a velocidade da água, e aumentando sua infiltração na mata, deverá reduzir as graves conseqüências das erosões.

6. Assoreamento dos brejos

Os brejos da Mata de Santa Genebra vêm sendo assoreados devido ao escorrimento de solo junto à água de chuva, decorrentes da área urbanizada próxima à sede, e das áreas de plantio, que após a colheita, aram o solo, deixando-o exposto.

A conscientização dos proprietários rurais, a manutenção da borda e o recolhimento das águas pluviais deverão resolver este problema.

7. Contaminação da água

Infelizmente, as nascentes da Mata de Santa Genebra são contaminadas por esgoto doméstico, provenientes de encanamentos de água pluvial que recebem ligações clandestinas de esgoto e que deságuam na mata, além do lançamento clandestino de águas servidas.

8. Uso de agrotóxicos

Apesar da proibição, vários agricultores do entorno utilizam defensivos agrícolas para proteger seus cultivos contra pragas. Estes produtos contaminam invariavelmente as nascentes, colocando em risco a qualidade da água e a vida de todos os organismos que dependem desta fonte de água para sobreviver.

9. Caça

A caça ilegal também é cometida em várias áreas da floresta, tanto em busca de alimento, com o abate de animais como capivaras e macacos, quanto para fins econômicos, com a captura e venda dos animais, especialmente aves, que possuem alto valor no mercado. Esta atividade é realizada por moradores de baixa renda do entorno, que buscam na caça uma opção de renda para sua subsistência.

A Fundação José Pedro de Oliveira busca coibir este tipo de atividade, com a vigilância constante de seu entorno, retirada das armadilhas da mata e conserto da cerca.

10. Presença de animais domésticos

A presença de animais domésticos, especialmente cães e gatos, são um grave problema na Mata de Santa Genebra, pois os mesmos não perdem suas características selvagens, e invadem a Mata para caçar aves e pequenos mamíferos. Este fato ocorre em função da proximidade das residências, e não há outra forma de combatê-lo senão a conscientização dos moradores em manter seus animais presos dentro de casa.

11. Presença de criminosos

A Mata de Santa Genebra, por ser uma área afastada da cidade e próxima da periferia, é utilizada como esconderijo e como local para descarte de objetos roubados. Para inibir este problema, contamos com a presença constante da guarda municipal, que faz rondas diárias na área.

12. Efeitos de borda

Um dos maiores problemas da Mata de Santa Genebra é o efeito de borda em seu entorno. Estas bordas, por não possuírem a vegetação original, são áreas perturbadas, com maior incidência de luminosidade, calor e ventos e menor teor de umidade que o interior da mata.

Estes fatores interferem no microclima da mata e fazem com que espécies vegetais oportunistas, como o capim e o cipó, se desenvolvam e sufoquem ainda mais a borda conservada da mata.